Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trappc5Q9CQA1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trappc5Q9CQA1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trappc5Q9CQA1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trappc5Q9CQA1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trappc5Q9CQA1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trappc5Q9CQA1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trappc5Q9CQA1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trappc5Q9CQA1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc5Q9CQA1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc5Q9CQA1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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