Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp2Q9CQ73 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp2Q9CQ73 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms