Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
1700029P11RikQ9CQ68 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms