Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rnaseh2cQ9CQ18 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms