Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chmp3Q9CQ10 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Chmp3Q9CQ10 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Chmp3Q9CQ10 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Chmp3Q9CQ10 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Chmp3Q9CQ10 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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