Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc18Q9CQ07 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc18Q9CQ07 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms