Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPN7

1810009J06Rik, RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810009J06RikQ9CPN7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1810009J06RikQ9CPN7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
1810009J06RikQ9CPN7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms