Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcl11bQ99PV8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms