Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf2a1Q99PM3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms