Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scd3Q99PL7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scd3Q99PL7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms