Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smim3Q99PE5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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