Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc24a3Q99PD7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc24a3Q99PD7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms