Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930550L24RikQ99PA7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms