Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GpnmbQ99P91 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms