Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bco2Q99NF1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco2Q99NF1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms