Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl43Q99N89 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl43Q99N89 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms