Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf17Q99MV7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf17Q99MV7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms