Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms