Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprtQ99M80 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprtQ99M80 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
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