Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdpd3Q99LY2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms