Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99KU6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99KU6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99KU6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q99KU6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q99KU6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q99KU6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q99KU6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q99KU6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q99KU6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q99KU6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q99KU6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q99KU6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99KU6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99KU6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99KU6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms