Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf34Q99KR6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms