Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms