Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Reep3Q99KK1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Reep3Q99KK1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms