Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hps4Q99KG7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hps4Q99KG7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms