Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ufsp2Q99K23 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ufsp2Q99K23 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms