Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TrabdQ99JY4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TrabdQ99JY4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms