Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lims1Q99JW4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms