Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddb2Q99J79 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ddb2Q99J79 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ddb2Q99J79 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ddb2Q99J79 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms