Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apobec3Q99J72 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms