Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Slc8b1Q925Q3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Slc8b1Q925Q3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Slc8b1Q925Q3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Slc8b1Q925Q3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Slc8b1Q925Q3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Slc8b1Q925Q3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc8b1Q925Q3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms