Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b5Q923D4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms