Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tubb6Q922F4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms