Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Odf3Q920N1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Odf3Q920N1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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