Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Afg3l1Q920A7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Afg3l1Q920A7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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