Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rrp1bQ91YK2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp1bQ91YK2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms