Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vps36Q91XD6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps36Q91XD6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms