Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx11Q91WL6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx11Q91WL6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms