Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q91WD4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q91WD4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q91WD4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q91WD4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q91WD4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q91WD4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q91WD4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q91WD4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q91WD4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q91WD4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q91WD4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q91WD4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q91WD4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q91WD4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q91WD4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q91WD4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q91WD4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms