Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd3Q91WC0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd3Q91WC0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms