Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klc3Q91W40 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Klc3Q91W40 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Klc3Q91W40 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms