Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp3Q91W36 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp3Q91W36 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms