Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfxn3Q91V61 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfxn3Q91V61 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms