Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Odf4Q8VI88 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Odf4Q8VI88 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms