Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cabp4Q8VHC5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cabp4Q8VHC5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cabp4Q8VHC5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms