Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SelenomQ8VHC3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms