Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc71Q8VEG0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc71Q8VEG0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc71Q8VEG0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms