Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg8Q8VE18 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Smg8Q8VE18 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Smg8Q8VE18 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg8Q8VE18 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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