Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sft2d2Q8VD57 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sft2d2Q8VD57 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms