Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam20bQ8VCS3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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